沖縄県保健医療部がまとめた２０１５年県内41市町村別平均寿命によると、石垣市は女性で86・６歳と最下位、男性で79・５歳と38位となった。前回調査（２０１０年）から女性は１・１年短く、順位も９位から大幅ダウンした。
調査は、厚生労働省が５年に１度実施しているもの。平均寿命は、沖縄県、全国とも前回調査よりも延びた。
郡内での最高順位は竹富町の男性80・５歳（13位）、女性87・４歳（20位）。与那国町は男性80・０歳（31位）、女性87・１歳（32位）。
県平均は男性80・３歳、女性87・５歳で、男女とも前回から延びたが、全国順位では男性が30位から36位に、女性が３位から７位に後退した。県は、働き盛り世代の死亡率が全国よりも高いことを要因に挙げている。
県は、２０４０年までに平均寿命全国一の達成を目標に掲げており、この結果を健康づくりの施策や活動に生かしていく考え。