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２０１４年の１年間に南ぬ島石垣空港の発着便を利用した乗降客数は、２００万人の大台を初めて突破した前年の２０６万９０２７人を12.38％上回る２３２万５２３０人に達したことが、石垣空港管理事務所のまとめで分かった。２０１３年３月７日の開港以降、乗降客数は右肩上がりに推移、前年に続き２年連続で過去最高を更新した。１日当たり６３７０人が乗り降りしたことになる。
国内線は２３０万７５６４人（前年比６.28％増）、台湾間の国際線は１万７６６６人（同20.97％増）といずれも増加した。
14年の乗降客数は、13年の途中から新規参入したピーチとスカイマークの年間通した数字が加わっており、初めて石垣空港に参入する航空５社の年間実績が出そろったことになる。
航空会社別では、開港以降、中型機を導入するなど路線を増強した全日空の98万４５９９人（同７.55％増）が２年連続で最多。日本トランスオーシャン航空（ＪＴＡ）は80万６９３０人（同０.53％減）とほぼ前年並み。琉球エアーコミューター（ＲＡＣ）は12万１０２９人（同３.19％増）となった。
初めての年間実績となるスカイマーク（ＳＫＹ）は25万９１９５人（同21.03％増）、ピーチ（ＡＰＪ）は13万５２１９人（同20.23％増）だった。
路線別でみると、東京間が41万９９２人（同30.67％増）、関西間が25万８０６６人（同12.27％増）と県外路線の伸びが顕著。基幹路線の那覇間は１３７万２１２１人（同３.16％）だった。
月別乗降客数は、観光シーズンピークの８月の24万８２５２人が最多。23万１２８７人を記録した３月が次に多かった。
一方、航空貨物は一般貨物が１万８７８４㌧（同３.10％増）と伸びる一方、郵便貨物は３８８㌧（同６.37％減）と減少した。
